Để chủ động ứng phó với mọi tình huống, giảm thiểu tối đa các thiệt hại do ảnh hưởng của bão số 3, Chủ tịch UBND TPHCM đã chỉ đạo: Thủ trưởng các sở ngành, đơn vị thành phố, chủ tịch UBND các phường, xã tập trung triển khai các biện pháp phòng tránh, ứng phó khi bão ảnh hưởng địa bàn thành phố, chuẩn bị sẵn sàng phương án chi tiết huy động vật tư, phương tiện, lực lượng để ứng phó với ảnh hưởng của bão.
Các đơn vị, địa phương ven biển, đặc khu Côn Đảo triển khai thực hiện phương án đảm bảo an toàn cho người và tàu thuyền hoạt động trên sông, trên biển, vùng sông nước. Theo dõi chặt chẽ bão số 3, thường xuyên thông báo cho các chủ phương tiện biết diễn biến của bão.

Bộ Tư lệnh thành phố, Công an thành phố, Cảng vụ Hàng hải thành phố, lực lượng Biên phòng thành phố chuẩn bị lực lượng, chiến sĩ, sẵn sàng huy động các phương tiện, trang thiết bị để ứng phó và tìm kiếm cứu nạn khi có tình huống.
Sở Xây dựng chỉ đạo triển khai các biện pháp cắt tỉa cây xanh, hạn chế tối đa việc cây xanh ngã đổ gây tai nạn khi xảy ra dông gió, mưa lớn do ảnh hưởng của bão. Công ty TNHH MTV Công viên cây xanh TPHCM xử lý nhanh các sự cố cây xanh ngã đổ do ảnh hưởng của bão số 3. Sở Văn hóa -Thể thao phối hợp Sở Xây dựng kiểm tra việc thực hiện chằng chống, gia cố các pa nô, biển quảng cáo… đúng kỹ thuật, đề phòng dông, lốc gây sự cố, tai nạn; hạn chế tổ chức các buổi biểu diễn văn nghệ, sân khấu ca nhạc ngoài trời…
Sở Du lịch, Tổng Công ty Du lịch Sài Gòn-TNHH MTV chỉ đạo không cho các tàu chở khách du lịch hoạt động trên sông, biển trong điều kiện thời tiết nguy hiểm, sóng to, gió lớn và kiểm tra chặt chẽ các biện pháp đảm bảo an toàn cho du khách trên tàu trước khi xuất bến.
Các cơ quan truyền thông, báo chí tăng cường cập nhật đưa tin liên tục, thường xuyên diễn biến của bão số 3 và chỉ đạo của các cơ quan chức năng cho toàn thể nhân dân trên địa bàn biết để chủ động phòng, tránh, ứng phó an toàn, hiệu quả.